中医方药数据库是集古今中药、方剂(处方)数据为一体的中型专业化数据库，由上海科学技术出版社自主研发建设，主要服务对象为从事中医药临床、科研、教学等工作的专业化人员。中医方药数据库目前约包括 10000 种中药(含民族药)和 15000 首方剂(处方)数据，基本上涵盖了目前可见、可用的中药和方剂。这些数据，是基于上海科学技术出版 60 余年来在这一方面的优质方药数据积累，包括相关的工具书(含《中药大辞典》《中医方剂辞典》《中华本草》《云南民族药》等)、高等院校教材(我社各版全国中医高等院校教材)、专著、古籍、图谱等优质资源。本社对这些数据拥有全部知识产权，各入库数据都经过严格审核和编辑加工，具有较好的科学性、准确性和权威性。本数据库项目也是一个开放的数据库，根据上海科学技术出版社每年新出版或再版的中药方剂类图书持续增加库容量(每年可约增加约 500 条数据)，以满足当前临床和科研实际应用需求。

中医方药数据库采用了 HDwiki 建库技术，所建的方药数据库具有操作便捷、响应灵敏、分类专业、安全稳定，以及全文搜索等优点，还具有统计、分析功能。本数据库数据查询分为模糊查询和高级查询，高级查询可根据方药的“名称”“来源”“功效”“主治”等不同搜索项精准查询，提高准确性和查询效率；模糊查询可在搜索框中直接输入所查询的内容，可在方药库中全文进行检索。本项目的中药库和方剂库既可单独成库，也可融合查询，满足深度知识查询或扩展知识查询的需要。同时，方药库还可与在建的中医案例库、中医古籍库、针灸经穴库等进行库库融合，为临床、科研、教学等工作提供理、法、方、药的整体解决方案。